GGAA-Microsatellites of NR0B1 Promoter Region in Ewing's Sarcoma Patients and Healthy Individuals of a Southern Brazilian Population / Microssatélites GGAA na Região Promotora de NR0B1 em Pacientes com Sarcoma de Ewing e Indivíduos Saudáveis de uma População no Sul do Brasil / Microsatélites GGAA en la Región Promotora de NR0B1 en Pacientes con Sarcoma de Ewing y Individuos Sanos de una Población del Sur de Brasil

Introduction: The very aggressive soft tissue and bone pediatric tumor Ewing's sarcoma (ES) is caused in most cases by the chromosomal translocation t(11;22)(q24;q12), which encodes an aberrant chimeric transcription factor (EWS-FLI1) that regulates target genes, including the critical oncogene NR0B1 (Xp21.2),via GGAA-microsatellites. Objective: Analyze the GGAA-microsatellites of NR0B1promoter region of ES patients and healthy subjects in the population investigated. Method: Ten male ES patients and 71 adult healthy males from Rio Grande do Sul state, Brazil, were included in this study. DNA from peripheral blood samples was extracted, amplified by PCR, sequenced by the Sanger method and analyzed by capillary electrophoresis. Total number of GGAA-motifs, length of microsatellite in base pairs, number of segments separated by "A" insertions, and the greatest number of consecutive GGAA-motifs were analyzed as well. Statistical analyses were performed in the SPSS statistical software and p-value <0.05 was considered significant. Results: A total of 21 different alleles was identified in the 81 subjects, with 24.2 allele [(GGAA)7A(GGAA)7A(GGAA)10] being the most frequent, but when comparing the data between the two groups, no significant difference was found. Conclusion: The sample investigated had a wide variation of microsatellite structure, including the presence of rare alleles, allowing the opportunity to describe this population as an essential step to identify genetic implications in ES tumorigenesis

Introdução: O sarcoma de Ewing (ES) é um tumor pediátrico de ossos e partes moles muito agressivo, causado, na maioria das vezes, pela translocação cromossômica t(11;22)(q24;q12), codificando um fator de transcrição quimérico aberrante (EWS-FLI1) que regula genes-alvo, incluindo o oncogene NR0B1 (Xp21.2), via microssatélites GGAA. Objetivo: Analisar os microssatélites GGAA da região promotora de NR0B1 em pacientes com ES e indivíduos saudáveis da população em investigação. Método: Foram incluídos dez pacientes do sexo masculino com diagnóstico de ES e 71 indivíduos adultos hígidos do sexo masculino do Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. O DNA foi extraído de sangue periférico e amplificado por PCR, sequenciado pelo método de Sanger e analisado por eletroforese capilar. Foram analisados o número total de repetições GGAA, comprimento total do microssatélite em pares de bases, número de segmentos separados por inserções "A" e maior número de repetições GGAA consecutivas. As análises estatísticas foram realizadas no software estatístico SPSS e o valor de p<0,05 foi considerado significativo. Resultados: Um total de 21 alelos diferentes foi identificado nos 81 indivíduos, com o alelo 24,2 [(GGAA)7A(GGAA)7A(GGAA)10], sendo o mais frequente; mas, ao comparar os dados entre os dois grupos, nenhuma diferença significativa foi encontrada. Conclusão: A amostra estudada é altamente variável em termos de estrutura de microssatélites, incluindo a presença de alelos raros, dando a oportunidade de descrever essa população, o que é uma etapa fundamental na identificação de implicações genéticas na tumorigênese do ES

Introducción: El sarcoma de Ewing (ES) es un tumor pediátrico de huesos y tejidos blandos muy agresivo, que se presenta con mayor frecuencia por translocación cromosómica t(11;22)(q24;q12), que codifica un factor de transcripción quimérico aberrante (EWS-FLI1) que regula los genes diana, incluido el oncogén NR0B1 (Xp21.2), a través de microsatélites GGAA. Objetivo: Analizar los microsatélites GGAA de la región promotora de NR0B1en pacientes con ES y personas sanas de la población investigada. Método: Este estudio incluyó a diez pacientes varones con diagnóstico de ES y 71 varones adultos del estado de Rio Grande do Sul, Brasil. El ADN se extrajo de sangre periférica y se amplificó por PCR, secuenciado por el método de Sanger y analizado por electroforesis capilar. El número total de repeticiones GGAA, longitud total de microsatélites en pares de bases, número de segmentos separados por inserciones "A" y el mayor número de repeticiones GGAA consecutivas fueran analizados. Los análisis estadísticos se realizaron con el software estadístico SPSS y se consideró significativo un valor de p<0,05. Resultados: Se identificaron un total de 21 alelos diferentes en los 81, siendo el alelo 24,2 [(GGAA)7A(GGAA)7A(GGAA)10] el más frecuente, pero al comparar los datos entre los dos grupos, no hubo diferencia estadísticamente significativa. Conclusión: La muestra estudiada es muy variable en cuanto a estructura de microsatélites, incluyendo la presencia de alelos raros, lo que nos permite la oportunidad de describir la población estudiada, lo cual es un paso fundamental en la identificación de implicaciones genéticas en la tumorigénesis de ES

TNF -308G > a promoter polymorphism (rs1800629) and outcome from critical illness

BACKGROUND: The susceptibility to adverse outcome from critical illness (occurrence of sepsis, septic shock, organ dysfunction/failure, and mortality) varies dramatically due to different degrees of inflammatory response. An over expression of tumor necrosis factor alpha (TNF-α) can lead to the progression of the inflammatory condition. OBJECTIVE: We assessed the relationship of the genotype distribution of -308G >A TNF-α polymorphism with regard to the development of sepsis, septic shock, higher organ dysfunction or mortality in critically ill patients. METHODS: Observational, hospital-based cohort study of 520 critically ill Caucasian patients from southern Brazil admitted to the general ICU of São Lucas Hospital, Porto Alegre, Brazil. Patients were monitored daily from the ICU admission day to hospital discharge or death, measuring SOFA score, sepsis, and septic shock occurrences. The -308G >A TNF-α SNP effect was analyzed in the entire patient group, in patients with sepsis (349/520), and in those who developed septic shock (248/520). RESULTS: The genotypic and allelic frequencies were -308GG = 0.72; -308GA = 0.27; -308AA = 0.01; -308G = 0.85; -308A = 0.15. No associations were found with sepsis, septic shock, organ dysfunction, and/or mortality rates among the TNF-α genotypes. Our results reveal that the -308G >A TNF-α SNP alone was not predictive of severe outcomes in critically ill patients. CONCLUSION: The principal novel input of this study was the larger sample size in an investigation with -308G > A TNF-α SNP. The presence of -308A allele is not associated with sepsis, septic shock, higher organ dysfunction or mortality in critically ill patients.

Análise da tendência temporal de dano renal agudo entre pacientes graves conforme polimorfi smos I/D e -262A > T da enzima conversora da angiotensina / Temporal trends in acute renal dysfunction among critically ill patients according to I/D and -262A > T ACE polymorphisms

A síndrome de disfunção de múltiplos órgãos e sistemas (DMOS) e a disfunção renal aguda compartilham muitos dos fatores fisiológicos envolvidos em seu desenvolvimento. Estudos recentes correlacionam suscetibilidades individuais, determinadas geneticamente, à disfunção de órgãos em pacientes criticamente enfermos, situação em que o gene da enzima conversora da angiotensina (ECA) poderia ser um candidato para elucidar predisposição ou risco genético. Nosso objetivo foi examinar os efeitos da presença de dois polimorfismos, I/D e -262A > T, na disfunção renal em pacientes agudamente graves do Sul do Brasil. O escore SOFA (sequential organ failure assessment) à admissão e a tendência da função renal (medida pelo escore renal diário do SOFA) foram determinados em pacientes de unidade de terapia intensiva (UTI). Um total de 153 pacientes adultos (79 homens) foi incluído no estudo. Houve monitoração diária da função renal durante toda a permanência na UTI e também pós-UTI. Observou-se a progressão para insuficiência renal (SOFA 3 e 4) nos primeiros sete dias de internação em UTI, bem como necessidade de diálise. As frequências genotípicas gerais em nossa amostra foram II = 0,17; ID = 0,46; DD = 0,37; e AA = 0,30; AT = 0,55; TT = 0,15; e as frequências alélicas foram I = 0,40, D = 0,60; e A = 0,56; T = 0,44. Este é o primeiro estudo para verificar a influência de polimorfismos I/D e -262A > T da ECA em disfunção renal aguda em pacientes críticos. Nenhuma associação significativa foi encontrada entre os genótipos ou as frequências alélicas e a evolução da função renal. Os polimorfismos I/D e -262A > T da ECA não têm impacto significativo sobre a evolução da função renal durante a primeira semana de internação na UTI nem exercem qualquer influência sobre a mortalidade em pacientes graves.

Multiple organ failure syndrome and acute renal dysfunction share many of physiologic factors involved in their development. Recent studies correlate the susceptibility to organ dysfunction in critically ill patients with genetic inheritance. Many of them consider ACE gene could be a possible candidate to elucidate a genetic predisposition or a genetic risk factor. We aimed to examine the effects of I/D and -262A > T ACE polymorphisms in the renal function in severely ill southern Brazilians patients. A multi-organic worldwide known failure score, the SOFA (sequential organ failure assessment), was used to determine the basal health state at first day (ICU admission). Considering admission SOFA score and trend of renal function (measured by daily renal SOFA scores, with daily measure of serum creatinine and diuresis), we hypothesize that ACE polymorphisms could influence in the trend of renal function in ICU patients. A total of 153 critically ill adult patients (79 men) were included in this study. We monitored the patients daily during their entire ICU and post-ICU (hospital) stay (measured from the ICU admission day to a maximum of 224 days). We observed progression to renal failure (SOFA scores 3 and 4) in first seven days of ICU stay and need for dialysis. The general genotypic frequencies in our sample were II = 0.17; ID = 0.46; DD = 0.37 and AA = 0.30; AT = 0.55; TT = 0.15, and the allelic frequencies were I = 0.40; D = 0.60 and A = 0.56; T = 0.44. This is the first study to verify the influence of I/D and -262A > T ACE polymorphisms in acute renal dysfunction among critically ill patients. No significant association was found between genotypes or allele frequencies and the trend of the renal function. The I/D and -262A > T ACE polymorphisms have no significant impact on the trend of renal function during the first week of ICU stay, neither any influence in mortality in critically ill patients.

Suscetibilidade genética na lesão pulmonar aguda e síndrome da angústia respiratória aguda / Genetic susceptibility in acute lung injury and acute respiratory distress syndrome

A lesão pulmonar aguda e sua forma mais grave, a síndrome da angústia respiratória aguda, são o denominador comum de várias doenças que podem provocar uma inflamação exagerada nos pulmões. Nos últimos anos, essa variabilidade tem sido atribuída, pelo menos em parte, a fatores genéticos. O presente estudo tem por objetivos revisar o papel dos principais genes envolvidos na suscetibilidade, morbidade e mortalidade na lesão pulmonar aguda e na síndrome da angústia respiratória aguda. Através de pesquisa nas bases de dados PubMed e LiLACS, empregando-se os unitermos lesão pulmonar aguda, síndrome da angústia respiratória aguda e síndrome da angústia respiratória do adulto em combinação com polimorfismos genéticos, foram selecionados 69 artigos, dos quais 38 foram incluídos nesta revisão. Foram também considerados artigos relevantes extraídos das referências bibliográficas nos artigos selecionados das bases de dados. Os polimorfismos genéticos são variantes gênicas presentes em pelo menos 1 por cento da população. A presença destas variantes genéticas pode influenciar a expressão de mediadores da resposta inflamatória, afetando diretamente a suscetibilidade à lesão pulmonar aguda, a intensidade da inflamação no parênquima pulmonar, a evolução e o desfecho destes pacientes. Estudos de associação com grandes populações e passíveis de reprodução permitirão de modo definitivo a inclusão da genômica no arsenal diagnóstico, prognóstico e terapêutico de pacientes com lesão pulmonar aguda/síndrome da angústia respiratória aguda

Acute lung injury and its most severe presentation, acute respiratory distress syndrome, are a common denominator for several diseases which can lead to exaggerated lung inflammation. In the last years this variability has been ascribed, at least partially, to genetic issues. This study aims to review the role of the main genes involved in acute lung injury and acute respiratory distress syndrome susceptibility, morbidity and mortality. By search on PubMed and LiLACS databases, using the key words acute lung injury, acute respiratory distress syndrome and adult acute respiratory distress syndrome in combination with genetic polymorphisms, 69 papers were selected, from which 38 were included in this review. Were also considered relevant articles extracted from the reference lists in the articles selected from the databases. Genetic polymorphisms are gene variations in at least 1 percent population. These gene variations may influence the inflammatory response mediators' expression, directly affecting the susceptibility to acute lung injury, the intensity of lung parenchyma inflammation, the development clinical course and outcome. Association studies reproducible in large populations will definitely allow genomics to be included into the diagnostic and therapeutic armamentarium for acute lung injury/acute respiratory distress syndrome patients.